Добрый день!
К сожалению, сталкиваюсь с такими проблемами довольно часто.
Вот небольшой "холивар" на эту тему: http://dev.1c-bitrix.ru/support/forum/f ... opic46007/

По сути проблемы: заменяем открывающий тега "<?" на "<?php" и все работает.