Вы не понимаете потому что не знаете.
Или наоборот: Вы не знаете потому, что не понимаете.
Call from '99051*******' (78.141.179.70:5060) to extension '99051*******' rejected because extension not found in context 'skype'. - говорит Вам: если и есть у вас там контекст skype, то нет там строчки
exten => 99051*******,1,Dial(куда там надо)
или шаблона
exten => _9X.,1,Dial(куда там надо)
Так как настраивали через вэб freePBX, то skype транк должен иметь контекст не skype, а from-trunk, и должна быть запись во входящей мершрутизации DID = 99051******* терминировать на внутренний номер такой-то.