В случае inband:
Да, можно сделать pcap запись, в Wireshark в RTP Analyzer можно проиграть RTP поток. Также его можно записать и просмотреть в том же WaveLab или SoundForge - посмотрите на длительности тонов и вообще есть они в записи или нет.
Эту запись и отправить прову, пусть пилят гири.
Что PT 96 появились при звонке транк-транк - хорошо! это говорит о том, что на Вашей стороне - всё ок.