Так это не глюки Mysql, это глюки архитектора вашей херомантии, по другому не назовёшь. Однажды вас (или кому там пистоны вставляют за простои) разбудят посреди сладкого сна, переходящего в ад, и вы поймёте,что следующие пару (а может и более) суток будете устанавливать asterisk на свежий хард. И в оконцове всё равно купите бесперебойник. Если, конечно, у вас на недоступность ваших номеров не всем пох.
И ещё - хз, кто ,что и как вам настраивал - asterisk должна работать и с лежащими БД cdr